臺大肝炎研究團(tuán)隊(duì)成功開發(fā)「病毒宿主嵌合DNA」 為B型肝炎病毒相關(guān)肝癌之新穎血液腫瘤標(biāo)記

B型肝炎病毒(Hepatitis B virus, HBV)感染肝細(xì)胞時(shí)，經(jīng)由病毒DNA隨機(jī)嵌入宿主肝細(xì)胞基因體，會在個(gè)別肝細(xì)胞基因體中產(chǎn)生獨(dú)特的「病毒宿主嵌合DNA序列」(virus-host chimera DNA, vh-chimera DNA)。肝細(xì)胞癌化過程所進(jìn)行之Clonal expansion，會導(dǎo)致大部分肝癌細(xì)胞均具有其獨(dú)特的vh-chimera DNA，成為個(gè)別肝癌之特異腫瘤標(biāo)記。有鑑於在約九成的HBV相關(guān)肝癌中皆存在vh-chimera DNA，且腫瘤細(xì)胞生長代謝時(shí)會將其基因體釋放至周邊血液，因此偵測血液中來自腫瘤之vh-chimera DNA，將有機(jī)會成為檢測涵蓋大部分B肝相關(guān)肝癌之新穎血液腫瘤標(biāo)記。

臺大醫(yī)學(xué)院由陳培哲院士所領(lǐng)導(dǎo)的肝炎研究團(tuán)隊(duì)，結(jié)合微生物學(xué)科葉秀慧教授、臺大醫(yī)院外科何明志教授與泰宗生物科技公司的共同合作，成功驗(yàn)證vh-chimera DNA作為肝癌之血液腫瘤標(biāo)記的可能性。針對50位接受手術(shù)切除肝癌之B肝肝癌病人，利用Capture-NGS技術(shù)平臺，在約九成患者之腫瘤組織中偵測到HBV DNA的嵌入。依據(jù)所偵測到的嵌入序列，為個(gè)別vh-chimera DNA設(shè)計(jì)特異性的微滴式數(shù)位核酸偵測分析(Droplet digital PCR，ddPCR)，結(jié)果顯示血液中vh-chimera DNA含量與腫瘤大小呈正相關(guān)性，可偵測到最小約1.5公分之肝癌；且其偵測的陽性率顯著高於臨床上廣為採用之血清標(biāo)記AFP及PIVKA-II，充分支持vh-chimera DNA可成為偵測肝癌之潛力血液腫瘤標(biāo)記。

有鑑於三分之一的肝癌病人於手術(shù)切除腫瘤後第一年內(nèi)發(fā)生復(fù)發(fā)，而降低患者總體存活率，研究團(tuán)隊(duì)因此進(jìn)一步嘗試?yán)么思夹g(shù)平臺，偵測患者術(shù)後兩個(gè)月所採集血液中之vh-chimera DNA含量，驗(yàn)證其是否可作為腫瘤復(fù)發(fā)之生物指標(biāo)。血中游離DNA的穩(wěn)定度低，半生期僅有數(shù)小時(shí)，因此若術(shù)後兩個(gè)月採集之血液中仍能測到vh-chimera DNA，即代表體內(nèi)仍存在腫瘤細(xì)胞，可能發(fā)生肝癌復(fù)發(fā)。研究結(jié)果顯示在術(shù)後兩個(gè)月血液中vh-chimera DNA呈現(xiàn)陽性的患者，有90%在一年內(nèi)發(fā)生復(fù)發(fā)，統(tǒng)計(jì)分析更清楚指出「術(shù)後兩個(gè)月血中vh-chimera DNA陽性結(jié)果」為一年內(nèi)肝癌復(fù)發(fā)與否之最顯著影響因子。此研究成果支持將「病毒宿主嵌合DNA」應(yīng)用於臨床上偵測術(shù)後B肝肝癌復(fù)發(fā)之可行性，利用抽血檢查即可進(jìn)行肝癌術(shù)後的復(fù)發(fā)追蹤，協(xié)助醫(yī)師盡早為病患提供適當(dāng)?shù)闹委?。目前此研究已進(jìn)行產(chǎn)學(xué)合作，並已進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段。

本研究除了提供一嶄新且可實(shí)際應(yīng)用於臨床檢測B肝肝癌之血液腫瘤標(biāo)記，HBV於肝癌基因體中獨(dú)特嵌入點(diǎn)之定位，亦可協(xié)助釐清復(fù)發(fā)肝癌與原發(fā)肝癌之同源性，並進(jìn)一步為後續(xù)治療提供重要參考。此研究成果已發(fā)表於《肝病學(xué)》(Hepatology)期刊，本篇論文同時(shí)獲得F1000Prime(The editorial team of the F1000 Gastroenterology & Hepatology Faculty)推薦為具有「special significance in its field」之論文，充分顯現(xiàn)對本研究成果之肯定。

全文請見：https://aasldpubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/hep.31230